اهداف مرکز تحقیقات بیماری‌های غیرواگیر :

• کسب مجوز نهایی تأسیس مرکز از مراجع ذی‌صلاح (وزارت متبوع و دانشگاه)
• تصویب چارت سازمانی مرکز و استخدام نیروهای لازم
• تلاش در جهت تشخیص بیماری‌های خاص و پیشبرد درمان آنها
• تلاش در جهت توسعه روش‌های درمان نوین
• توسعه فضای فیزیکی متناسب با اهداف و برنامه‌های مرکز (تأکید بر تأسیس ساختمان مناسب و مستقل)
• فراهم کردن زیرساخت‌های لازم جهت توسعه تحصیلات تکمیلی از لحاظ تنوع رشته و تعداد دانشجو (پذیرش و پیشنهاد کارشناس ارشد پژوهشی)
• تأسیس و ثبت حداقل یک شرکت دانش‌بنیان وابسته به مرکز
• فراهم کردن زیرساخت‌های لازم جهت ارائه خدمات تخصصی در رابطه با اجرای طرح‌های تحقیقاتی اعضای هیئت علمی و مراکز وابسته به دانشگاه علوم پزشکی رفسنجان و سایر سازمان‌ها و نهادهای دولتی و خصوصی.
• فراهم کردن زیرساخت‌های لازم جهت کاربردی کردن (تبدیل به محصول) نتایج تحقیقات مرکز برای تولید مواد و وسایل پزشکی و رفع کمبودها
• افزایش بحث و تبادل‌نظر منطقه‌ای در برنامه‌های پیشگیری و کنترل بیماری‌های غیر‌واگیر
• ترویج همکاری‌ها در زمینه آموزش و تحقیقات بیماری‌های غیر‌واگیر
• تقویت ظرفیت پژوهشی و حمایت از انجام تحقیقات مناطق اولویت‌دار با بیماری‌های غیر‌واگیر
• بالا بردن اولویت بیماری‌های غیر‌واگیر در سطوح مختلف و ادغام برنامه‌های  پیشگیری و کنترل این بیماری‌ها در تمام سیاست‌های ادارات دولتی
• ایجاد و تقویت سیاست‌های ملی و برنامه‌ای برای پیشگیری و کنترل بیماری‌های غیر‌واگیر
• ارتقاء مداخلات به‌منظور کاهش عوامل خطر اصلی و مشترک برای بیماری‌های غیر‌واگیر (مصرف دخانیات –رژیم غذایی ناسالم – عدم فعالیت بدنی – و سوءمصرف الکل (
• ارتقاء پژوهش‌ها جهت پیشگیری و کنترل بیماری‌های غیرواگیر
• ارتقاء مشارکت برای پیشگیری و کنترل بیماری‌های غیرواگیر
• تهیه ابزاری برای تصمیم‌گیری‌های بهداشت عمومی مبتنی بر شواهد با هدف کاهش اپیدمی‌های در حال ظهور بیماری‌های غیر‌واگیر
• آماده‌سازی زیرساخت‌های حمایتی جهت انجام پژوهش‌های پیشگیرانه و انجام مداخلات مؤثر.
• ارتقاء سطح دانش، تقویت و توسعه ظرفیت‌های بهداشت عمومی و خدمات بهداشتی اولیه در پیشگیری از بیماری‌های غیر‌واگیر.
• مطالعه بار بیماری‌ها؛ توزیع بیماری‌ها، عوامل خطر و سوانح و حوادث در جمعیت کشور و همچنین، در سطوح استانی، دانشگاهی و شهرستانی.
• همکاری در ارتقاء برنامه‌های مقابله با بیماری‌های غیر‌واگیر
• جمع‌آوری گسترده تمامی اطلاعات قابل‌استفاده در کشور از طریق انجام مطالعات مرور نظام‌مند و دستیابی به مطالعات ملی و استانی
• انجام مطالعات پژوهشی که با کمک آن‌ها بتوان میزان اثر مداخلات سلامت را سنجید.
• پژوهش‌های که منجر به تولید شواهد مرتبط با بیماری‌های غیر‌واگیر
• ارتقاء سلامت از طریق تحقیقات، مطالعات و شناسایی عوامل خطر (با اولویت‌بندی عوامل خطر مشترک ) بیماری‌های غیر‌واگیر و ارائه شواهد علمی جهت ذینفعان اعم از سیاست‌گذاران، مدیران (در همه سطوح) پرسنل بهداشتی درمانی، محققین و جامعه  در زمینه مقابله با این عوامل. 
• کمک به طرح اصلاح نظام سلامت کشور با محوریت بیماری‌های غیر‌واگیر